Станков  не  отличался  крепким  здоровьем, его  мечте  остаться  в  университете  пришлось  осуществиться  спустя  30  лет.  Под  непосредственным  руководством  К. И. Мейера  он  пишет  дипломную  работу.

Весной  1917 года  Станков  уезжает  в  Крым, в Никитский  сад, с  надеждой  через  год  вернуться  на  кафедру. Однако  выехать  из  Крыма, да  еще  с  семьей,  в 1918  году  оказалось  невозможно. И  он  остается, продолжает  работать  вместе  с  ботаниками  Н. И. Кузнецовым, Е. В. Вульфом, В. И. Папладиным. Своим  друзьям – коллегам  С.С. Станков  посвящает  книгу «Южный  берег Крыма»/ 1926 г./

В Горький  С.С. Станков  приехал  в  декабре  1922 года  в  связи  с  избранием  его  заведующим  кафедрой  ботаники  университета. В 1923 г. Государственный  ученый  совет /ГУС/ утверждает  С.С. Станкова  в  звании  профессора, а  кафедру  ботаники  переименовывают  в  кафедру  морфологии  и  систематики  растений.

Приступив  к  работе  С.С. Станков,   принял  ботаническую  лабораторию, состоящую  из  одной  комнаты. Хозяйство, прямо  скажем, несложное, так  что  кафедру  пришлось  создавать  почти  на  пустом  месте. В короткий  срок  была  организована  хорошо  оборудованная  лаборатория, оснащенная  новейшей  техникой.

Уже  через  два года после  приезда в Горький Сергей Сергеевич думает  об  изучении  флоры  и  растительности  Нижегородской  губернии.

В 1925 г. университет  направил  Станкова  в  качестве  делегата  в  Ассоциацию  по  изучению  производительных  сил  Нижегородской  губернии, где  он  был  избран  членом  президиума  и  ученым  секретарем. Находясь  на  этом  посту, он  активно   развернул  деятельность  по  исследованиям  Нижегородского  края: ботанических, антропологических, почвенных, геологических, фаунистических  и уробиологических, этнографических, лингвистических.

Особенно  следует  отметить  организацию  им  нижегородской  геоботанической  экспедиции. В  ее  задачи  входило: произвести  полное  геоботаническое  описание  всей  губернии: составить  геоботаническую  карту.

Экспедиция  работала  в  течение  1926-1928 г..  По  инициативе  Станкова  к  работе  были  привлечены  и  московские  ботаники: проф. В.В. Алехин, Н.А. Кац  и  др. Экспедиции  трех  лет  по  изучению  Горьковской  области, как  отмечает  сам  Станков, были  крупными  по  своим  масштабам. Область  пересечена  на  протяжении   16200 км,  собран  обширный  гербарий,  содержащий  свыше  30 тыс. листов.

Как  соавтор Сергей Сергеевич участвует  в  составлении карт; «Карта  восстановительного  растительного  покрова – геоботаническая  теоретическая  карта»  и  «Карта  современного  растительного  покрова – геоботаническая  практическая  карта» / под  ред. В.В.Алехина/.

В итоге   работ  геоботанической  экспедиции  под  редакцией Станкова были  опубликованы    , материалы  исследований:  «Производительные  силы  Нижегородской  губернии», вып. №2. 1926г.: вып. №6, 1927 г.; вып. №9, 1928 г.; вып. №13, 1929 г.

Однажды  на  лекции  он  рассказывал  студентам  о  строящемся  /1926 г./  при  деревне  Курзе  /близ г. Балахны/  бумкомбинате, перед  которым  встала  проблема  использования  воды  из  местных  водоемов. На  конкретном  примере Станков  показал, что,  зная  экологию  водорослей  можно  быстро  и  безошибочно  определить  качество  воды.

В течение 25 лет /1923 – 1948 гг./  Сергей Сергеевич вел  большую  педагогическую работу. Им  прочитаны  лекционные  курсы  по  анатомии  и  морфологии  растений, систематике  низших  и  высших  растений, систематике  цветковых,  географии  растений, ботанической  географии  СССР, истории  ботаники. В Горьковском  университете Станков  создал  школу  ботаников.

Его  непосредственные  ученики  являются  кандидатами  биологических  наук: Ф.А. Александров,

З.Н. Горохова, Б.М. Зефиров, Н.Б. Илларионов  и  др. 

Открытый  по  декрету  Ленина  28  марта  1918 г. Нижегородский  университет,   в 1930 г. был  преобразован  в  ряд  институтов. И  когда  в  августе  1931 г. по  решению  Совнаркома  университет  был  восстановлен  в  составе трех факультетов: биологического, физико – математического и химического, Станков принимает  непосредственное  участие  в  жизни  биологического  факультета. При  его  содействие  были  вновь  организованы  биологические  станции: в 1933 г. – кафедра  зоологии   позвоночных, в 1935 г. – кафедра  физиологии  растений.

В 1933 г. профессор  Станков  поставил  перед  городскими  властями  вопрос  о  создании  Ботанического  сада  в  г. Горьком, представив  проект  с  указанием  задач, целей  и  структуры  сада. Осенью  1943 г. был  утвержден  проект  сада, директором  сада  назначили  профессора  Станкова.

В 1936 г. по  совокупности  научных  работ  Станкову  была  присвоена  ученая  степень  доктора  биологических  наук.

В 1936 г. выходит  его  книга «Очерки  физической  географии  Горьковского  края». Она  выдержала  три  издания / 1933, 1935, 1944 гг./ о лекарственных  растениях /1945, 1952 гг./.

В годы  ВОВ, когда  страна  особенно  нуждалась  в  лекарственном  сырье, Станков  публикует  ряд  рекомендаций  о  сборе, сушке  и  заготовке  лекарственных  растений  Горьковской  обл.  Позднее, обобщив  литературные  данные, он  опубликовал  книгу «Полезные дикорастущие  растения  СССР»  /1946, 1951 гг./.

Научно-педагогическую  деятельность  в  высшей  школе  Станков  сочетал  с  участием  в  общественной  жизни  города. Более  10  лет  он  состоял  депутатом  Городского  совета  в г. Горьком, заботился  об  озеленении  города, выступал  в  местной  печати  с  научно-популярными  статьями.

Плодотворная  научная  и  общественная  деятельность  Станкова  была  отмечена  высокими  правительственными  наградами – орденами:  Ленина, Трудового  Красного  Знамени, медалью «За  доблестный  труд  в  ВОВ». В 1948 г. Станков   переезжает  в  Москву. Он  был  избран  заведующим  кафедрой  геоботаники  биологического  факультета  МГУ.

В  составе  делегации /14 чел./ летом 1954 г. он  выезжает  во  Францию  на  12 международный  ботанический  конгресс  и  выступает  на  конгрессе  с  докладом «Растительный  покров  Крыма  и  основные  закономерности  его  структуры».

В 1957 г.  Станков  получает  приглашение  от  Венгерской  Академии  Наук /г. Будапешт/ на  сессию, посвященную  двухсотлетию  со  дня  рождения  выдающегося  венгерского  ботаника  П. Китайбеля. Затем  у  него  состоялась  поездка  в  Болгарию, где  он  знакомится  с  флорой  и  фауной  этой  страны.

Уже  больной, он  продолжает  активно  участвовать  в  Совете  ботанических  садов  при  АН СССР, в  комитетах  организованных  в  связи  с 250 – летием  со  дня  рождения  К. Линнея  и  100 – летием  со  дня  смерти  Гумбольдта.

В  1959 г.  Станков  оставляет  заведывание  кафедрой, но  продолжает  читать  лекции  и  занимается   написанием   давно  задуманной  книги  «Человек  и  растение». За  время  творческой  деятельности  Станковым было  опубликовано  сто  работ. До  конца  жизни  он  сохраняет  живой  интерес  к  работе. Свою  последнюю  рукопись  закончил  22  августа  1961 г.

Летом  1962 г.  здоровье  Сергея Сергеевича  ухудшилось, 14  октября  его  жизнь  оборвалась.